La boîte supérieure montre le contexte général et la stratégie de l'approche de modélisation − Les contraintes évolutives structurelles et fonctionnelles sont reflétées par des conservations et corrélations caractéristiques dans des alignements multiples de séquences de protéines homologues. Ceux-ci sont capturés par des modèles de séquences statistiques, comme les modèles de profils (conservation seulement) et les modèles coévolutionnaires (conservation et coévolution). Ces modèles sont utilisés pour extraire une multitude d'informations à partir de données de séquence, comprenant des contacts résiduels dans les protéines (lignes rouges en bas à gauche), des interactions protéine-protéine (lignes vertes en bas au centre, la ligne rouge est une fausse prédiction, les lignes grises sont des interactions non détectées) et des effets mutationnels dans les protéines.