La voie de dégradation des acides gras dépend de l’organe qui les métabolise. Pour produire de l’ATP, les acides gras suivent deux voies en fonction de l’organe cible. S’il est gluco-indépendant (par exemple le foie ou le muscle), ils vont subir la bêta-oxydation avant d’entrer dans le cycle de Krebs. Si l’organe est gluco-dépendant (par exemple le cerveau), les acides gras vont être transformés en corps cétoniques dans le foie avant de rejoindre la circulation sanguine pour se diriger vers les organes cibles, où ils seront re-transformés en acétyl-CoA. Ce dernier pourra alors subir le cycle de Krebs pour produire de l’ATP.