Les recherches sur le paludisme à l’heure post-génomique

Malaria research in the post-genomic era

Unité d ’immunologie Moléculaire des Parasites, CNRS URA 2581, Institut Pasteur, 25, rue du Docteur Roux. 75015 Paris, France. Tél. : 33 (0)1 45 68 86 23. Fax : 33 (0)1 40 61 35 84. E-mail : omp@pasteur.fr

Résumé

La détermination de la séquence génomique de Plasmodium falciparum et de plusieurs espèces au sein du genre Plasmodium, ainsi que celles d’Anopheles gambiae, du génome humain et du génome de la Souris et du Rat ont entièrement changé le paysage de la recherche fondamentale sur le paludisme. Il est urgent d’exploiter au mieux cette masse de données nouvelles pour développer de nouveaux outils de lutte. De vastes perspectives de recherches s’ouvrent pour la découverte de nouveaux médicaments, l’identification de cibles vaccinales, la dissection fine de la cascade d’évènements consécutives à l’infection chez les diverses espèces vectrices et chez l’hôte vertébré, ainsi que pour l’analyse des interactions complexes conduisant à la pathologie ou au contraire contribuant à la protection et à son maintien. La biologie des populations dispose désormais d'outils d’une puissance inégalée pour étudier les échanges génétiques au sein des populations naturelles, et identifier les facteurs qui structurent les populations parasitaires et les populations de vecteurs. Néanmoins, des obstacles importants demeurent ne serait-ce qu’en raison de la lourdeur des systèmes expérimentaux et des difficultés à évaluer la pertinence des modèles animaux. Les défis à relever sont forts nombreux; ils appellent à une organisation meilleure des efforts de recherche pour les explorations systématiques qu’offrent les nouvelles technologies de la post-génomique et le développement des nouveaux outils et modèles expérimentaux que nécessitent l’ère de la génomique fonctionnelle et la biologie intégrative dans laquelle nous sommes entrés.

Abstract

Genomic sequence determination of Plasmodium falciparum and other species of the genus, as well as that of Anopheles gambiae, and human, rat and mouse genome sequencing have completely changed the landscape of fundamental research about malaria. These data should urgently be exploited, in order to develop new tools to combat the disease: new drugs, fine dissection of the cascade of events following infection of the various vector species and vertebrate host, analysis of the complex interaction leading to the pathology or, inversely, contributing to sustained protection. Powerful population biology tools are now available, allowing to investigate genetic exchanges within natural population and to identify factors structuring parasitic and vector populations. Nevertheless, important impediments persist, including the complexity of experimental systems and the unclear relevance of animals models. Numerous challenges are to be faced; they call upon a more efficient organisation of research efforts in the systematic explorations using the powerful novel post-genomic technologies, as well as the development of new tools and experimental models required by functional genomics and integrative biology.