Article

Protéomique circadienne

Circadian proteomics

¹ Institut de Bioingénierie, Faculté des Sciences de la Vie, École Polytechnique Fédérale de Lausanne, 1015 Lausanne, Suisse
² Département de Pharmacologie et Toxicologie, Université de Lausanne, 1005 Lausanne, Suisse

^* Auteur correspondant: frederic.gachon@epfl.ch

Reçu : 2 Octobre 2018

Résumé

Les progrès récents des techniques de protéomique offrent de nouvelles perspectives pour la biologie circadienne, et en particulier la possibilité d’étudier des modifications post-traductionnelles telles que la phosphorylation et l’acétylation. En utilisant la protéomique in vivo sur des extraits totaux de foie de souris ou des extraits nucléaires, nous avons pu caractériser le protéome rythmique du foie avec une résolution sans précédent, et ainsi révéler de nouveaux processus rythmiques tels que la sécrétion des protéines, la synthèse des ribosomes, la réparation de l’ADN ou la polyploïdie. De plus, l’analyse des modifications post-traductionnelles a permis de mettre en évidence les voies de signalisation impliquées et les conséquences sur le métabolisme hépatique.

Abstract

Recent development in the proteomic technologies offers new perspectives in circadian biology and in particular the possibility to study post-translational modifications such as phosphorylation and acetylation. Applying in vivo proteomics on whole liver or on nuclear extracts, we were able to characterize the rhythmic liver proteome with unprecedented coverage. It allows the characterization of new rhythmic processes such as protein secretion, ribosome biogenesis, DNA repair, and polyploidy. In addition, the analysis of rhythmic post-translational modifications helps to understand the signal pathways involved and their consequences on hepatic metabolism.