« Entre systèmes modèles et conservation phylogénique, le projet DrosoMan de protéomique comparative entre l’Homme et la Drosophile ou l’association de moyens industriels et de la science artisanale pour établir les maillons faibles des ensembles protéiques »

“Using model organisms and phylogenetic conservation, the DrosoMan project combines high tech hand-made science and industrial know-how to target the Achilles heel of cancer cells. A comparative proteomic project that associates Academia and Biotech”

¹ Inserm U528, Institut Curie, 26, rue d’Ulm, 75248 Paris cedex 05. E-mail : jcamonis@curie.fr
² Hybrigenics SA, 3-5, impasse Reilles, 75014 Paris. E-mail : ldaviet@hybrigenics.fr

Résumé

L’annotation fonctionnelle est un défi pour les biologistes confrontés aux quantités d’informations fournies par les projets de séquences des génomes des Vertébrés, des organismes modèles, des micro-organismes. Mais le savoir-faire de la recherche fondamentale « classique », qui se prête mal à des approches massives, est à la fois indispensable pour une compréhension approfondie, et insuffisant pour affronter l’énormité de la tâche. Inversement, quelques techniques sont industrialisables et permettent une description en termes de « protéomique fonctionnelle », en aval de la génomique. L’Institut Curie et Hybrigenics ont pris conscience de leur complémentarité et ont établi une alliance dans le domaine du cancer et de la signalisation. Cette alliance s’est concrétisée autour d’un projet de protéomique fonctionnelle comparative entre l’Homme et la Drosophile. De nouveaux partenaires de protéines pourtant très étudiées ont été ainsi définis, de nouveaux réseaux sont apparus, et des « domaines biologiques » qui paraissaient indépendants sont connectés grâce à la profondeur des cribles et des analyses subséquentes.

Abstract

The post-genomic era offers a huge challenge for scientists used to hand-made tailored approaches that can deal with deep insight into a small number of objects. Reciprocally, industry is used to undergo massively parallel approaches, dealing with large numbers but rather shallow insight. The complementation is obviously tantalizing, and Institut Curie and Hybrigenics (HGX) have signed an alliance in the field of cancer and signal transduction. A comparative proteomic approach was undertaken, where ortholog baits from Homo sapiens and flies were used to screen extremely complex two-hybrid cDNA libraries. New partners of “old” proteins have been identified, new networks have emerged, and unexpected connectors have been shown to link biological niches supposed to be independent.